قرص های افلوکساسین در افرادی که سابقه حساسیت بالایی در استفاده از افلوکساسین یا هر یک از اعضای گروه کینولون داروهای ضد میکروبی دارند ، منع مصرف دارد.

تجویز قرص افلوکساسین در غیاب عفونت باکتریایی اثبات شده یا به شدت مشکوک یا نشانه ای پیشگیری کننده بعید است که به نفع بیمار باشد و خطر ابتلا به باکتری های مقاوم به دارو را افزایش می دهد.

درد شکم و گرفتگی شکم ، درد قفسه سینه ، کاهش اشتها ، خشکی دهان ، افتادگی ، خستگی ، نفخ شکم ، پریشانی دستگاه گوارش ، عصبی بودن ، فارنژیت ، خارش ، تب ، بثورات ، اختلالات خواب ، خواب آلودگی ، درد تنه ، ترشحات واژن ، اختلالات بینایی و یبوست.

در بیماران مبتلا به نارسایی / اختلال نارسایی کلیوی یا کبدی شناخته شده یا مشکوک ، رعایت دقیق بالینی و بررسیهای آزمایشگاهی مناسب باید قبل و در طول درمان انجام شود زیرا از بین بردن افلوکساسین ممکن است کاهش یابد